克隆引物设计
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/29 09:29:09
Oligodt不需要设计,用试剂盒里面的就行.如果你RT的引物想用自己的,那你需要扩增的基因序列应该是明确的吧.RT的时候'引物没太多的选择性,mRNA序列跟反义链配对,因此RT的引物要根据正义链(就
完全可以,PCR长度从50bp到数百都可以,不止局限于150-300个碱基对.楼上说的有道理,但是有一点要注意,最好计算一下扩增片段的Tm值,这样做溶解曲线的时候,光有一个峰还不够,而且得到的TM和你
怎样用primer-blast设计引物http://wangyufeng222.blog.163.com/blog/static/128222070201110511213331/
用PP5.0或oligo软件.网上有很多说明书的,操作十分简单再问:等于白说
你看,你分别获得了1-1200nt以及1000-1400nt这两段序列,那么中间有200bp长度的序列是重叠的,对吧?也就是说你已经从序列信息上获得了这个CD区所有的序列信息.如果你只是需要序列信息的
构建载体需要酶切的,所以需要加接头的!
首先要知道这段基因的序列,然后可以用软件来设计,如Primer我就知道这个,看到别人用,很好推荐
就问题本身而言,引物合成回来是固体粉末,你把它溶于水中,再做一步变性退火就行了(不过由于是hairpin,形成二聚体的可能性也很大,这个似乎不可避免).另外我不太明白为什么要用hairpin的引物?在
PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否.要设计引物首先要找到DNA序列的保守区.同时应预测将要扩增的片段
可能是模板结构问题,多试几种PCR试剂,个人觉得Takara的LA扩增能力比较强
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
这一步骤是将目的DNA片段构建到某载体(质粒)上,并转化大肠杆菌保存.当然最有可能的就是基因克隆.引物可以理解为PCR的指针,确定需要扩增的片段,通过PCR即可扩增出正反向引物之间的DNA片段.
用primerpremie
一、可以使用oligo6或者primer5等软件设计.用这些软件选择引物,主要就是看引物的稳定性,形成二聚体的可能性,退火温度等等参数.二、如果你的序列同源性不高,GC含量也还可以的话,可以使用一些经
NCBI有免费的设计软件非常好用,权威把你的序列贴到最上方的空格就可以了,开始的时候,所有的参数都用系统的默认值就可以,不需要修改.
是从NCBI里面的序列库中搜索的,自动搜索符合筛选条件的序列,从而给出引物序列blast是要求NCBI里面有的序列才能验证.你研究的物种基因组测序结果发布了吗?如果发布了的话就不用担心序列不全了
首先查道你的基因序列(NCBI搜),第二查引物设计原则,第三下载个引物设计软件设计,简单好用的有primerpremier5.0,这些都能在网上搜到,软件用法也能搜到.
普通PCR是基因克隆的基础,原理一致.基因克隆在于所扩的序列是未知的,现在很多生物的全基因序列已经公布,多重序列比较设计简并引物,克隆出保守区域的片段,在通过RACE等方法把上下游的序列扩出来.
一般使用primer5就挺好,不知道你是扩基因还是启动子,基因是否是已知.PCR引物设计原理:PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关
建议你先上网学习一下引物设计最简单的一些知识我设计引物是用Omiga软件的,使用比较简单,只要新建一个核酸文件,把目的基因序列粘贴进去,扩增全长的话一般都是手工选取18~22bp长度,再加入内切酶碱基